共享6个基因结构猜测剖析东西

　　ORFfinder用于剖析查找序列中的ORF区 (open reading frame，开放阅读框)。ORFfinder运用规范的或其它特别的遗传暗码子查找序列中所有或许的ORF区，并推导出相应的氨基酸序列。

　　在线版别的ORFfinder可提交最长50kb的序列，当然也能够下载Linux本地版别，这样就没有序列长度的约束。这儿以家鼠的AQP1序列（NM_007472.2）为例，将最小的ORF长度设为75nt，仅运用“ATG”作为开始暗码，然后点Submit按钮。

　　Softberry包括数百个有用的在线剖析小东西，其间，咱们比较了解的FGENESH是一款较为精确的真核基因猜测东西。

　　软件的用法很简单，将DNA序列复制粘贴到序列输入框，或许点击上 “挑选文件”按钮，上传DNA序列文件，然后查找并挑选核酸序列所对应的物种，比方我这儿的典范文件是人的序列，然后点击“search”按钮提交使命即可。

　　提交使命数秒后会得到猜测成果，如下图，从成果中咱们咱们能够看出从提交的序列（74293bp）找到3个基因，正链2个，负链1个；找到外显子18个，正链16个，负链2个。

　　Promoter 2.0大多数都用在猜测脊椎动物DNA序列中Pol II（RNA聚合酶Ⅱ）发动子的转录开始位点（发动子）。它根据神经网络和遗传算法，模仿转录因子与发动子区序列相互作用的进程。

　　IBS (illustrator for biological sequence)是一个制作基因蛋白序列结构示意图的在线东西，个人主张，假如不知道怎样着手制作的时分，可参阅示例文件的款式进行制作。

　　SMART有两种形式：normal和genomic。首要区别是二者底层运用的数据库的不同，前者是冗余的，而后者只运用完结基因组测序的蛋白组数据。两种形式的色彩不同，而界面类似，经过单击相应形式可进行切换，比方进入genomic形式是这样的：

　　经过输入Uniprot/Ensembl蛋白序列的ID（或ACC）或许蛋白序列查找蛋白的结构域。点Sequence SMART按钮即可提交使命，大约10秒后即可得到下图的猜测成果，网页的结构图是交互式的，还可保存为svg格局的矢量图。